En Chile, el cultivar Cabernet Sauvignon presenta una variante del fenotipo tradicional de planta, la que se diferencia únicamente en el tamaño de sus racimos, haciendo difícil su identificación y separación a la hora del establecimiento de un viñedo. La forma variante produce un tipo de racimo mas grande y pesado que el tradicional, confiriéndole un mayor potencial en su productividad. Se evaluaron dos poblaciones, una perteneciente al vivero del INIA Cauquenes (conservación de material variante) y otra localizada en Villa Prat (viñedo comercial). Se estableció un patrón molecular, a través del uso de 40 diferentes marcadores moleculares. Paralelamente, se estableció un patrón ampelográfico de las plantas en estudio, a través del análisis de diversos caracteres morfológicos. El uso de una secuencia ancho red primer específicamente el numero 811, arrojo dos bandas diferenciadoras entre ambos tipos de racimos, una de 800 pb que se presentaba en individuos de racimos cortos y no se presentaba en individuos de racimos largos, esto independiente de la localidad de origen de las muestras. Además de una banda cercana a los 340 pb que estaba presente en los individuos de racimo largo y no en los racimos cortos. Por otra parte, el uso de dos combinaciones de retro transposones, PBScop/U5inv y R1/R2, entregaron diferencias polimórficas entre los individuos de Villa Prat y de Cauquenes, tanto de racimo corto como de racimo largo, Estas diferencias polimórficas fueron visualizadas en geles de agarosa y en geles de poliacrilamida. Posteriormente, las bandas generadas por estos marcadores moleculares fueron utilizadas para la confección de un fenograma representativo de los cultivares estudiados, utilizando el paquete estadístico computacional NTsys versión 2.1. Además se realizó un AMOVA el cual indico la existencia de diferencias altamente significativas entre las poblaciones de racimos cortos y racimos largos. El estudio ampelográfico apunto a la existencia de diferencias morfológicas altamente significativas, existentes solo en el largo del racimo, entre ambas poblaciones, esto fue evaluado a través de la prueba estadística de Kruskal Walli