Se recolectaron sarmientos de doce cepajes de Vitis vinifera destinadas a la elaboración de pisco y vino respectivamente. Los sistemas isoenzimaticos utilizados fueron: fosfoglucoisomerasa (PGI), fosfoglucomutasa(PGM) y malato deshidrogenasa(MDH). De los tres sistemas analizados, PGI presento el mayor nivel de polimorfismo, y fue posible diferenciar cuatro de los siete cepajes blancos utilizados. Sauvignon blanc, Sauvignonasse, Semillon y Gewurztraminer registraron actividad, a diferencia de Chardonnay, Chenin blanc y Riesling. En el caso de los cinco cepajes para pisco utilizados, solo Moscatel rosada presento un patrón isoenzimatico distinto, diferenciándose de Moscatel de Austria, Moscatel de Alejandría, Torontel y Pedro Jiménez, que presentaron un mismo patrón de tinción