Dentro de las exigencias del mercado de producción acuícola mundial, influye el aspecto externo del pez, como color de la piel y forma del cuerpo, ambos factores influencian el precio de los salmonidos. La trucha arcoiris (Oncorhynchus mykiss) no es la excepción en este tipo de exigencia, actualmente la tendencia es producir un fenotipo mas plateado y con menor cantidad de manchas en la piel, parecido al que presenta el fenotipo de coloración de la piel llamado dorso azul. Dentro de este contexto, en la presente memoria se planteo como hipótesis que, existe variación genética asociada al rasgo dorso azul de pigmentación de la piel de trucha arcoíris. Los genes que dan cuenta de esta variación cosegregan con marcadores moleculares del tipo RAPD. En concordancia con la hipótesis planteada, el objetivo fue identificar marcadores RAPD asociados al fenotipo dorso azul en trucha arcoíris. Para llegar a una respuesta de lo anteriormente planteado en la piscícola Huililco (IX región), durante la temporada 2004 se tomaron muestras de sangre de truchas arcoíris de fenotipo normal y dorso azul. Posteriormente se realizo un análisis de ADN (screening) con 300 partidores RAPD, utilizando el método del selective DNA pooling para detectar polimorfismos RAPD asociados con el fenotipo dorso azul. Con esta aproximación se detecto un fragmento polimórfico de 450 pb amplificado con el partidor RAPD UBC-009 positivamente asociado a dorso azul (X2 l g.l.= 6,35; P<O.05). Este polimorfismo queda disponible para el desarrollo de marcadores tipo SCAR con potencial uso en selección asistida por marcadores (MAS)