Las investigaciones en el área de la biología molecular se han visto favorecidas gracias a la creciente disponibilidad de marcadores moleculares, desde aquellos basados en Fragmentos de Restricción Polimórficos (RFLP) y PCR, se han derivado múltiples herramientas como son la Amplificación de ADN al Azar (RAPD). Fragmentos Polimórficos de ADN Amplificados (AFLP), mini satélites (VNTR) y micro satélites (SSR). Destacan en particular estos últimos, ya que han sido considerados una herramienta bastante eficaz y confiable al momento de realizar análisis de diversidad genética e identificación de variedades, característica que resulta bastante útil para la certificación genética de clones, un paso fundamental que ha tomado fuerza en diferentes empresas y centros de investigación. El objetivo de este trabajo fue validar y seleccionar de SSRs con características adecuadas para ser utilizados en el proceso de Geno tipificación. Para este fin se utilizo una población referencial de 30 genotipos de P. radiata sobre la cual fueron probados 33 SSR marcados con fluoroforo y 68 marcados con tag. los mejores en cada caso fueron seleccionados con el fin de realizar Multiplex PCR y posterior validación de datos entre laboratorios. Los datos generados resultaron ser iguales independiente del laboratorio donde se haya realizado el procedimiento, esto permite validar la técnica y demostrar la efectividad de estos marcadores