La Población microbiana de los suelos derivados de cenizas volcánicas está caracterizada por una alta incidencia relativa de hongos y actinomicetos; la población de bacterias en cambio aparece claramente deprimida. Esto constituye una característica fundamental de estos suelos desde el punto de vista de la ecología microbiana y los distingue claramente de los suelos no alofánicos. Los niveles altos de carbono orgánico, que indican acumulación de materia orgánica, la gran capacidad de retención de agua y el alto grado de agregación serian una consecuencia de la alta actividad bioquímica en general, y enzimática en particular, que presenta la flora microbiana de estos suelos. Por otra parte, los bajos niveles de pH favorecerían paralelamente la preeminencia ecológica de hongos y actinomicetes sobre la población bacteriana.